Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HSPB3Q12988 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms