Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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