Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH1Q08174 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms