Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SSBP1Q04837 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms