Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GCNT1Q02742 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms