Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NHLH2Q02577 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms