Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms