Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF17Q02223 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms