Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MS4A2Q01362 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MS4A2Q01362 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms