Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MDM2Q00987 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MDM2Q00987 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms