Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCE1P61221 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.1 ms