Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CASP9P55211 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms