Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGDP52209 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGDP52209 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGDP52209 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGDP52209 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGDP52209 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PGDP52209 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGDP52209 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGDP52209 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGDP52209 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGDP52209 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGDP52209 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGDP52209 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms