Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMARCA2P51531 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms