Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms