Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GSK3BP49841 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms