Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTPAP49638 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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TTPAP49638 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TTPAP49638 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTPAP49638 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTPAP49638 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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