Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLMP48507 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCLMP48507 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCLMP48507 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCLMP48507 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCLMP48507 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCLMP48507 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GCLMP48507 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCLMP48507 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms