Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTGIRP43119 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms