Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GDF5P43026 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GDF5P43026 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GDF5P43026 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms