Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PPARGP37231 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms