Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHI3L1P36222 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms