Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP214P35658 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP214P35658 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms