Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPB2P35606 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPB2P35606 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPB2P35606 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms