Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPN7P35236 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPN7P35236 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms