Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP1P32455 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP1P32455 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP1P32455 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP1P32455 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP1P32455 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP1P32455 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP1P32455 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP1P32455 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GBP1P32455 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GBP1P32455 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GBP1P32455 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms