Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXA13P31271 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA13P31271 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms