Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM5AP29375 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM5AP29375 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms