Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PEX2P28328 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PEX2P28328 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms