Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMB5P28074 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB5P28074 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms