Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD27P26842 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD27P26842 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD27P26842 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms