Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ITGA3P26006 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ITGA3P26006 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ITGA3P26006 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ITGA3P26006 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ITGA3P26006 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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ITGA3P26006 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ITGA3P26006 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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