Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2AP24928 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms