Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PTPRBP23467 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PTPRBP23467 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PTPRBP23467 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PTPRBP23467 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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