Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA1P20827 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms