Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRHP20396 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRHP20396 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRHP20396 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRHP20396 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRHP20396 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms