Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTPS1P17812 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms