Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB3P14651 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms