Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KRT10P13645 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KRT10P13645 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KRT10P13645 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms