Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEFHP12036 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NEFHP12036 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEFHP12036 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEFHP12036 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEFHP12036 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NEFHP12036 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NEFHP12036 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEFHP12036 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEFHP12036 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEFHP12036 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEFHP12036 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEFHP12036 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEFHP12036 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEFHP12036 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEFHP12036 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NEFHP12036 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NEFHP12036 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms