Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DMDP11532 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DMDP11532 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DMDP11532 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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