Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TFPTP0C1Z6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms