Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEFLP07196 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEFLP07196 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms