Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PAPLNO95428 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms