Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CCNDBP1O95273 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CCNDBP1O95273 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CCNDBP1O95273 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CCNDBP1O95273 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCNDBP1O95273 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1O95273 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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