Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBXN7O94888 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBXN7O94888 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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