Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEC24DO94855 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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SEC24DO94855 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEC24DO94855 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEC24DO94855 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC24DO94855 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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