Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KDM4AO75164 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms