Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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NPHP4O75161 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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NPHP4O75161 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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NPHP4O75161 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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NPHP4O75161 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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NPHP4O75161 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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NPHP4O75161 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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NPHP4O75161 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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NPHP4O75161 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPHP4O75161 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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NPHP4O75161 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
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NPHP4O75161 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPHP4O75161 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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