Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PPFIA3O75145 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms